特にサイト運営者に断ることなくリンクしています。
各情報へのリンクを制限することは、インターネットの趣旨に反します。

無断リンクの是非についての論争
http://ja.wikipedia.org/wiki/%E7%84%A1%E6%96%AD%E3%83%AA%E3%83%B3%E3%82%AF
誰しも自分が探している情報に最短のルートでアクセスしたいはずです。
その情報が格納されているサイトのトップページに誘導して、そこからメニューを辿って目的の情報を探させるなどはナンセンスです。

トップページへのリンクを推奨するものであって、強制するものではありません。
サイトの構造等が変わりリンク切れになるかもしれないのでトップページへリンクしてねという意味合いと捉えました。

リンク切れになる可能性はありますが、リンクする側はそれを承知の上でリンクしております。

トップページからリンクしたのでは、ユーザーのニーズに応えられないというのも理由の一つです。

そもそも検索エンジンで検索した場合は、トップページが必ず出る訳ではなく、途中のページが検索ヒットしてダイレクトにそのページを開くことは珍しくありません。